目前生物体至少可分为五界系统，真菌界是其中之一。该界包含一系列不同的真核生物，遍布自然界，从活体或死亡的有机物中吸收营养。
    真菌的分类和鉴定主要根据其外观，而不象细菌那样以营养和生化差异为主要依据。霉菌的营养期由分枝的丝状体或菌丝组成菌丝体。低等的霉菌菌丝没有横隔，进化程度较高的菌丝有横隔。真菌的繁殖体，或称孢子，由单个或由包在一个硬壁内的数个细胞组成。在长期的进化过程中，大多数真菌依靠其有性和无性两种方式繁殖。它的有性孢子及其周围结构是真菌分类的主要依据。但是，某些真菌的无性阶段有助于快速繁殖，而有性阶段却退化或消失。对于这类真菌，其无性孢子的形状或产孢结构的特点就是鉴定菌种的重要依据。
     酵母菌是一种单细胞真菌，由分离的圆形、卵圆形或延长的细胞组成。通过自表面发芽产生同样的子细胞进行繁殖。发芽的子细胞可与母细胞分离或继续附着于母细胞并产生新芽，这样多个子细胞连接在一起形成孢子链，常称为“假菌丝”。在临床上，我们常常通过标本涂片镜检中寻找酵母菌假菌丝来判断其有无致病，因为在医学上一些重要的真菌可以根据不同的环境而以菌丝相或酵母相存在。

   在已记录的50,000-250,000种真菌中，与人类疾病有关的真菌不足200种。一般来说，这些真菌生活在自然界，不需要依靠人或动物而生存。除个别情况外，人类的真菌感染病原体菌来自于外部环境，通过吸入、摄入或外伤植入而进入人体。 
   只有少数真菌可引起正常人疾病，而大多数真菌则只是在某些特殊情况下才致病，常侵犯衰弱的宿主。随着现代医学的发展，各种创伤性检查和治疗、器官移植、广谱抗生素的广泛应用，使一些原本无害的真菌引发人类疾病越来越多。目前认为，任何一种可以在宿主体温（37摄氏度）和低氧化还原状态（受损害组织的一种特性）下生存的真菌均属于潜在性人类致病真菌。
      

    浅部真菌病是指限于皮肤最外层、甲板、毛发和粘膜的感染。主要的感染真菌是皮肤癣菌和浅表念珠菌病。这些感染大多轻微，容易诊断，治疗效果好。
    皮肤癣菌仅侵犯表皮的角化组织、毛发和甲板。大多数不能独立生存来与其他环境中的嗜角质真菌竞争，故需要依靠宿主与宿主之间的互相传播来获得生存。这些专性致病真菌可能是由非特异性的腐生型真菌进化而来。在进化过程中，大多数真菌不再进行有性繁殖，其中有些甚至也不进行有性繁殖。一般说来，专性致病真菌已经进化到能较好地适应人体环境，宿主细胞只会对其产生轻微或不明显的炎症反应。
    念珠菌病的病原菌与皮肤癣菌相同，完全依赖于寄生宿主的方式存活，但其方式上又有所不同。这些病原真菌中最主要的是白念珠菌，它是人类消化道，包括口腔的正常菌群。来自其他宿主的这类真菌是很少引起明显的人类疾病的。它可以重新建立与新宿主间的共生关系。这些真菌一般情况下并不会引发疾病，但当宿主内部环境发生了变化，自然防御能力受到了削弱，这些真菌就可以导致粘膜、皮肤或深部的内源性感染。近年来，播散性念珠菌病已经成为较常发生在免疫缺陷或全身衰竭病人身上的可危及生命的疾病。

   皮下组织真菌病是侵犯真皮、皮下组织和骨骼的真菌感染。常通过外伤后植入的方式，使得土壤和腐败植物中腐生的病原真菌进入皮肤而发生感染。感染好发于热带和亚热带地区的乡村人口。这些地区的居民常赤足或着装很少，因此容易受到伤害。损害可局限于外伤植入部位或播散到临近组织。通过血液或淋巴管引起的广泛播散较少见。广泛播散只见于全身衰竭的宿主。

   系统性真菌病的感染常起源于肺，可以播散到全身许多器官。其致病菌腐生于土壤或腐败有机物中，或作为植物致病菌。通常以吸入的方式将致病真菌孢子吸入而发生感染。
   引起深部真菌感染的病原体可分为两组：真正的致病真菌和条件致病真菌。致病真菌仅由少数致病菌组成，如荚膜组织胞浆菌和粗球孢子菌等，它们可以侵入没有明显易感因素的正常宿主，并在人体组织中繁殖。这些致病菌具有独特的形态学特征。而条件致病菌是由低毒性和适应性较差的真菌如烟曲霉等组成，只能侵犯免疫力低下或衰竭的宿主组织。